Когда-то давным-давно полукровка Балто спас весь город от болезни,доставив лекарство вовремя.С тех пор прошло 2 года.У него родились дети.Всех щенков удалось отдать,кроме девочки Алу.Она очень расстроилась,когда узнала,что она тоже полукровка.Отец сказал ей,что братьям и сёстрам повезло,так как они были похожи больше на собак,чем на волков,а Алу больше была похожа на волка,чем на собаку.Расстроившись Алу убежала из дома,в надежде узнать,кто она: волк или собака.Но отец следует за ней пройдя множесво преград,ему всё-же удаётся отыскать свою дочь,и вместе они находят стаю,которая голодает,так как все олени перешли на другой остров по мосту из льдин.И молодая волчица Алу помогает стае перейти на другой берег,заверив отца,что с ней всё будет в порядке.Много лет прошло с тех пор, как отважный Балто расстался с дочерью Алу. У неё родилась дочь по имени Эзумрит. Шли годы, малышка росла и всё казалось таким безоблачным и радужным… Но не тут-то было. Охотники напали на след стаи. Им приглянулась мать Эз, которая вскоре погибла от пули, спасая дочь. Прошло несколько дней, Эзумрит нашёл Балто. Он приютил волчицу у себя.

В стае раскол. Половина волков решила разыскать наследницу, а половина, озлобленная на полукровок и собак, возглавленная старшим братом наследницы, обосновалась возле города и решила перебить всех. Балто решает сражаться, вот только помогут ли им волки, разыскивающие Эзумрит? Узнают ли они её по прошествии стольких лет? А главное, успеют ли они помочь собакам?